Está armado con el cañón automático multipropósito 2A42 de 30 mm, que tiene una cadencia de disparo máxima de 550 disparos por minuto, pudiendo ...disparar 300 disparos por minuto a una velocidad sostenida. En la misma torreta, se monta una plataforma 9Sh119M1 encargada de disparar los misiles 9M113 Konkurs (designación OTAN AT-5 Spandrel), lo que otorga al BTR-90 una apreciable capacidad antitanque, con un alcance máximo de 4 kilómetros y una velocidad de vuelo de 200 metros por segundo
